De ledende farmakonomer på sygehusapotekerne er omfattet af overenskomsten for ledere på Sundhedskartellets område, indgået af Danske Regioner og Farmakonomforeningen, se i højre spalte.

Ledernes lønskala består af trinene L1- L16. Det aftales lokalt, hvor i lønskalaen den enkelte stillings grundløn skal indplaceres.

Der tages udgangspunkt i stillingens kompetenceområde, ansvar og opgaver, der fremgå at stillings- og funktionsbeskrivelsen.

Desuden har ledere adgang til tillæg i henhold til Aftale om lokal løndannelse.